Desde siempre, la calidad ha sido para EMA el centro de su atención y de su política industrial.

Se ha obtenido el certificado ISO 9002 en el año 1996 y el ISO 9001-2000 en el año 2003.

La empresa tiene certificado OHSAS 18001 desde 2005

Desde 2007 EMA Pharmaceuticals está en tramites para la obtención de la certificación ISO 15378.

Al final de cada lote de fabricación se emite un certificado de conformidad ; ese certificado acompaña cada entrega de producto.