Depuis toujours, EMA a placé la propreté et la qualité au centre de ses préoccupations et de sa politique industrielle.

La certification ISO 9002 a été obtenue en 1996 et ISO 9001-2000 en 2003.

L'entreprise est certifiée OHSAS 18001 depuis 2005.

Depuis 2007, EMA Pharmaceuticals s'est engagée dans une démarche visant à la certification
ISO 15378.

Un certificat de conformité est émis à la fin de chaque lot de fabrication et accompagne chaque livraison.